Sicher dass der QR-Code-Leser nicht einfach schon beim Hinhalten des Handys den QR-Code gelesen hat?
Es ist zwar möglich in PDFs "Software" unterzubringen, aber sowohl Android als auch iOS führen die Software in PDFs nicht einfach aus ohne bei dir zumindest irgendein Prompt zu bringen. Und insbesondere kann so eine Software keine Schnittstellen wie den NFC-Chip deines Handys aktivieren.
Also theoretisch schon möglich, aber das wäre dann nur mit Mossad oder CIA-Qualität von Hacking möglich ^^